Antybiotyki jako substancje silnie bakteriobójcze niszczą florę chorobotwórczą i fizjologiczą mikroflorę probiotyczną (tzw. "dobre bakterie"). Powoduje to, że inne mikroorganizmy (m.in grzyby) kolonizują niszę uprzednio zajętą przez bakterie probiotyczne. W wyniiku tego dochodzi do ponatybiotykowych grzybic przewodu pokarmowego oraz skóry.